Shigeru Miyamoto on kertonut IGN:lle, ettei Pikmin 3:een tule verkkomoninpeliä. Kyseisen valinnan takana ovat Mario Kartien antamat oppitunnit siitä kuinka tärkeää ja vaikeaa pelitoiminnan synkronisoiminen verkon yli voi olla.
Miyamoton mukaan Pikmin 3 on erityisen haastava, koska siinä on niin paljon pieniä hahmoja joiden jokaisella liikkeellä ja sijainnilla on suuri merkitys pelin etenemiselle. Siksi he ovatkin keskittyneet yksinpeliosuuteen sekä paikalliseen moninpelikokemukseen verkkomoninpelin sijasta.