The Legend of Zelda: Wind Wakerista julkaistaan ehostettu HD-versio Wii U:lle syksyllä, mutta se ei tule sisältämään alkuperäisestä leikattuja luolastoja.
Tämä johtuu siitä, että nämä luolastot on jo käytetty. Sarjan tuottaja Eiji Aonuma myönsi tuoreeltaan, että myöhemmät Zelda-pelit hyötyivät Wind Wakerista jääneestä sisällöstä.
The Legend of Zelda: The Wind Waker HD tulee kuitenkin olemaan Gamecube-versiota hiotumpi kokemus, ja Aonuman mukaan erityisesti sen tahditusta on nyt hiottu kokemuksen tiukentamiseksi.