Julkaisija Take-Two on haastanut Duke Nukem Foreveriä hallinnoineen Apogee-yhtiön oikeuteen. TT:n mielestä on Apogeen syy, että pelin kehittämistä ja julkaisupäivää ei saatu pidettyä kurissa. Nyt kun peliä tehtaillut studio 3D Realms meni nurin, se on loppupeleissä Apogeen vika, että mitään ei koskaan saatu valmiiksi. Take-Two haluaa Apogeelta 12 miljoonaa dollaria korvauksina katteettomista lupauksista aiheutuneesta kivusta ja särystä.