Ubisoftin kaavailema uusi kopiosuojausmenetelmä on nostattanut kulmakarvoja PC-piireissä. Assassin's Creed II:n PC-versioon tuleva suojausmenetelmä edellyttää, että pelaajalla on jatkuva yhteys Internetiin. Yhteyden katketessa pelaaja voi menettää etenemisensä sitten viimeisen pelitallennuksen. Pahimmillaan nettipakosta voikin muodostua ikävä ongelma kaikille PC-pelaajille, vaikka tarkoituksena on vain piraattikopioiden torjuminen. Assassin's Creed II ilmestyy PC:lle 4. maaliskuuta Director's Cut -versiona, joka sisältää pääpelin ohella kaksi ensimmäistä lisäosaa.