The Binding of Isaacin kehittäjä Edmund McMillen on paljastanut twiitissä, että pitkän sisäisen väittelyn jälkeen Nintendo on päättänyt kieltää Isaacin julkaisemisen eShopissaan 3DS:lle. Syyksi ilmoitettiin "kyseenalainen uskonnollinen sisältö", joka viittaa Isaacin alkuperään samannimisenä raamatullisena tarinana jossa jumala pyysi Abrahamia uhraamaan poikansa.
McMillen on ymmärrettävän murheellinen päätöksestä, mutta kiitti viestissään jumalaa Steamin olemassaolosta. Samalla paljastettiin, että peliä suunniteltiin myös PS3:lle, mutta sopimus Microsoftin kanssa blokkasi tämän vaihtoehdon, täysin muista kuin uskonnollisista syistä.