Nintendon pressitilaisuus E3:ssa aloitettiin Pikmin 3:n esittelyllä. Herra Miyamoton mukaan Wii U:lla jokaisen pikku pikminin puuhat voi viimeinkin erottaa tarkasti kiitos tarkemman grafiikan, ja niiden joukko tuleekin laajenemaan Pikmin 3:ssa. Myös strategiaa on syvennetty, koska uuden Gamepadin kosketusnäyttö auttaa pyörittelemään karttaa kätevämmin.
Pelissä voi ohjata neljää johtajaa, joiden tilanteen voi nopeasti tarkistaa kiitos uuden pelijärjestelmän. Tuttua Olmaria ei tosin joukossa näkynyt, salaisista syistä. Miyamoto sanoo Nintendon haluavan tarjota Pikmin 3:lla syvempää pelikokemusta tänä kevyiden pelien aikakautena.