FIFA 21 -pelin ohjaus on tehty siten, että yksi ja sama toiminto tekee eri asiaa tilanteesta riippuen. Tämä tekee pelaamisesta ajoittain tarpeettoman vaikeaa.
EA Sports on tietoinen ongelmasta, ja asiasta kootaan palautetta, ja parannuksia tullaan tekemään. Saattaa kuitenkin olla, että ne parannukset nähdään vasta pelissä FIFA 22.