Pro Evolution Soccer 2012 sisältää uuden Teammate-ohjauksen, joka mahdollistaa kahden kenttäpelaajan kontrolloinnin samanaikaisesti. Kehittäjä Konamin mukaan tämä avaa mielenkiintoisia mahdollisuuksia hyökkäyspeliin.
Ominaisuus on toteutettu oikean analogiohjaimen varaan, ja pelaajat voivat valita käyttävätkö avustettua vai täysin manuaalista versiota. Manuaalinen mahdollistaa toisen kenttäpelaajan täydellisen ohjaamisen, kun taas avusteinen rajoittuu juoksuliikkeiden tekemiseen.
Toinen pelaaja aktivoidaan kääntämällä oikeaa analogiohjainta pelaajan suuntaan ja painamalla R3-nappia.
Teammate-ohjaus korvaa hetkellisesti pelaajan tekoälyn ja mahdollistaa entistä ihmismäisempien hyökkäysliikkeiden tekemisen. Kakkospelaajalla voi esimerkiksi syöksyä vapaaseen maalipaikkaan samalla, kun ensimmäisellä kuljettaa palloa.